依據〈H1N1 新型流感中央流行疫情指揮中心〉公佈截至12月21日下午5時的《H1N1新型流感疫苗疑似不良事件監測每週摘要》指出不良事件通報率為《每10萬劑有 8।8 件》即已注射的481萬劑中,有424件不良事件通報,其中93例疑似嚴重不良事件;或許不良事件發生率很低,但非危險群的民眾應有權自己衡量利弊得失,決定是否施打國內提供的新流感疫苗 (至11月止,台灣人口有23,109,141人;疾管局網站截至12/21下午5時,顯示有822例新流感住院案例,其中有35例死亡案例)
目前已經過審議小組判定的3例,結論均號稱與新流感疫苗施打無關,目前爭議中的台中小一兒童個案,據新聞顯示疾管局指示:應與疫苗無關(見12/22 蘋果新聞);到底是不是與疫苗有關,民眾對國光疫苗的不信任,或許疾管局應公布國光和諾華各施注多少劑,各出現多少不良事件,出現之症狀各為何,以釐清民眾的不安 (雖然非頭對頭的RCT,難以直接比較兩者的安全性,但至少回溯觀察性研究還是可以提供一些證據支持)。